Папуа в настоящее время переживает процесс разделения на две провинции (выделение Западного Папуа). Вместе с Ачехом они представляют собой три из 34 провинций Индонезии, обладающих особым статусом. Обе провинции идентифицируют себя как одно целое – Республику Западное Папуа, имеют одинаковый этнический состав и общее историческое прошлое в рамках единой территории Ириан-Джая (Западная Новая Гвинея). В 2001 г. в ходе повстанческой борьбы против центральной власти провинции Ириан-Джая был предоставлен автономный статус.
У Папуа есть «материнское государство» - Папуа-Новая Гвинея (между ними сухопутная граница). Региональные сепаратисты рассматривают федерацию с Папуа-Новой Гвинеей в качестве одного из возможных вариантов существования папуасских провинций после гипотетического провозглашения независимости.
Титульной группой выступают папуасы, составляющие около 88% населения провинций. Ключевыми параметрами для выделения титульной этнической группы выступают раса, религия и язык. Папуасы – меланезийцы, в то время как большинство населения Индонезии – малайцы по расовому признаку. Специфический язык папуасов также отличен от языка большинства населения Индонезии. Христианство является доминирующей религией в Папуа, в отличие от большинства индонезийцев, которые следуют Исламу.
Провинция обладает относительно широкой этнокультурной автономией. В Папуа создан особый орган – Народное Собрание Папуа (Papua People's Assembly). Он представляет собой традиционный институт туземцев и занимается вопросами защиты прав коренных жителей Папуа (обычаи, культура), а также гармонизацией религиозной жизни.
Современная ситуация в папуасских провинциях характеризуется этнополитической нестабильностью. «Движение за свободное Папуа» продолжает бороться с центральным индонезийским правительством за создание независимого государства. В регионе регулярно происходят столкновения, теракты и убийства.